30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1911 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
258 aa  517  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  38.25 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  40 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  37.85 
 
 
239 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  34.47 
 
 
253 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  39.06 
 
 
236 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  34.72 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  48.72 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  26.29 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  30.77 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  31.61 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  31 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  32.26 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  26.17 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  43.24 
 
 
215 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  37.66 
 
 
387 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  25.69 
 
 
210 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  44.07 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  30.37 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0205  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.37 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  31 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  40.3 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  37.89 
 
 
313 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  27.92 
 
 
243 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  26.75 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  42.25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  32.61 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.1 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.1 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3399  purine or other phosphorylase family 1  28.65 
 
 
181 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>