77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3399 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3399  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 		 181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6409  nucleoside phosphorylase-like protein  43.58 
 
 		 194 aa  87.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81632  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0882  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  32.34 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3696  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.53 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3067  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.14 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.418066  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3241  nucleoside phosphorylase-like protein  27.13 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  28.49 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0765  MTA/SAH nucleosidase  29.61 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0961162 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  28 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0528  MTA/SAH nucleosidase  24.42 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0176375  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2188  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.84 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0485  adenosylhomocysteine nucleosidase  31.29 
 
 		 217 aa  50.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3254  nucleosidase, putative  27.32 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0367638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2507  nucleoside phosphorylase-like protein  26.8 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2641  nucleoside phosphorylase-like protein  26.8 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345305  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.74 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.49 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  37.97 
 
 		 253 aa  48.5  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.34 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.97 
 
 		 233 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  27.78 
 
 		 249 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.07 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0494  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.7 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2657  nucleoside phosphorylase-like protein  26.8 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.63 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.57 
 
 		 466 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.09 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.92 
 
 		 459 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3137  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.88 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.603402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1253  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.88 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1134  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.88 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.459075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.92 
 
 		 459 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1027  methylthioadenosine nucleosidase  28.14 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.09 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.56 
 
 		 233 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1220  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.88 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0698  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1564  purine phosphorylase family 1  28.57 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.44 
 
 		 232 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0977  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.94 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.52 
 
 		 458 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2966  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 		 230 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1001  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.95 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1176  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.25 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.633739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.74 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.74 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3052  methylthioadenosine nucleosidase  26.25 
 
 		 236 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.84 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17250  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.22 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1322  5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.25 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1217  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.54 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.34 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2874  methylthioadenosine nucleosidase  26.25 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.00179592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2801  methylthioadenosine nucleosidase  27.38 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.783975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2956  methylthioadenosine nucleosidase  25.62 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0322899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0828  Adenosylhomocysteine nucleosidase  30.56 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1192  nucleoside phosphorylase  27.78 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  45 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0164  methylthioadenosine nucleosidase  41.94 
 
 		 251 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0422  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  36.59 
 
 		 258 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.78 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  29.41 
 
 		 258 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1115  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.25 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.84 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2777  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.09 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.33 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0526  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2560  MTA/SAH nucleosidase  24.44 
 
 		 238 aa  42  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  32.03 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.03 
 
 		 233 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1338  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  44.26 
 
 		 272 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1515  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.34 
 
 		 228 aa  41.2  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.266051  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.23 
 
 		 279 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0112  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.94 
 
 		 229 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.87 
 
 		 258 aa  40.8  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.23 
 
 		 279 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0400  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  41.67 
 
 		 260 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>