81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2777 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2777  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  100 
 
 		 212 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3518  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  65.09 
 
 		 212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4572  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  65.67 
 
 		 212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0328  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  64.29 
 
 		 212 aa  270  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0494  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  64.04 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4309  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  66.17 
 
 		 212 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0448  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  61.31 
 
 		 220 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3057  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  60.1 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0327  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  58.82 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0360  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  58.82 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.459155  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3294  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  54.73 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0698119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2657  nucleoside phosphorylase-like protein  37.95 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2507  nucleoside phosphorylase-like protein  37.77 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3254  nucleosidase, putative  37.57 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0367638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3241  nucleoside phosphorylase-like protein  36.11 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2641  nucleoside phosphorylase-like protein  37.77 
 
 		 195 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345305  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  33 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3696  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  32.14 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3067  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.16 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.418066  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1473  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.64 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.63 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.63 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.27 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0977  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.72 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0699  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.32 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  27.49 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.24 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.93 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25.84 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.04 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0882  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.84 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.26 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0230  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.15 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.632822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0246  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.15 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0670161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.74 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0244  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.15 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0228  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.15 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.819967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.02 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0227  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.21 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I07  MTA/SAH nucleosidase  22.68 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.179437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00157  hypothetical protein  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3443  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0169  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0151  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00158  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.94081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0171  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3500  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0164  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0163  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17250  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.19 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1192  nucleoside phosphorylase  26.49 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0765  MTA/SAH nucleosidase  28.02 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0961162 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0377  putative nucleosidase, Pfs protein  24.19 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3086  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.86 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4456  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4507  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4270  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4118  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4454  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2130  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.65 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.343593  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.23 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2476  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4602  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  30.05 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1027  methylthioadenosine nucleosidase  23.56 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1299  MTA/SAH nucleosidase  29.38 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0016425  hitchhiker  0.0031404 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  40 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.17 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4493  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.4 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  40 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06520  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.17 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0743  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.4 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4107  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.4 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.56 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4221  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.4 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3399  purine or other phosphorylase family 1  26.09 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  38.18 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  50 
 
 		 264 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  28.81 
 
 		 236 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>