43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0448 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0448  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4309  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  63.05 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0328  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  63.55 
 
 		 212 aa  257  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3518  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  64.04 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4572  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  60.59 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2777  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  61.31 
 
 		 212 aa  245  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0494  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  58.97 
 
 		 221 aa  234  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0360  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  57.77 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.459155  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0327  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  57.77 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3057  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  59.49 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3294  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  54.36 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0698119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3241  nucleoside phosphorylase-like protein  32.65 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3254  nucleosidase, putative  33.33 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0367638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2507  nucleoside phosphorylase-like protein  33.33 
 
 		 195 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2657  nucleoside phosphorylase-like protein  32.43 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2641  nucleoside phosphorylase-like protein  31.82 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345305  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  32.84 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3696  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  35.29 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1473  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.48 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3067  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.71 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.418066  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0882  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.38 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.89 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.89 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.75 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0527  MTA/SAH nucleosidase  27.1 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.148978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.75 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.29 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.42 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.75 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.5 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.61 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0602  methylthioadenosine nucleosidase  28.06 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.14 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.32 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I07  MTA/SAH nucleosidase  24.02 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.179437  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  24.36 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2050  methylthioadenosine nucleosidase  30.82 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00216128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2956  methylthioadenosine nucleosidase  25.32 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0322899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3052  methylthioadenosine nucleosidase  23.42 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0528  MTA/SAH nucleosidase  22.78 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0176375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2874  methylthioadenosine nucleosidase  25.32 
 
 		 236 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.00179592 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0606  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.12 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.74 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>