82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4572 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Alignment on homolog gene

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4572  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  100 
 
 
212 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4309  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  94.34 
 
 
212 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0328  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  75.47 
 
 
212 aa  333  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3518  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  70.19 
 
 
212 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0327  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  65.05 
 
 
210 aa  277  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0360  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  65.05 
 
 
210 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.459155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3057  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  64.73 
 
 
216 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2777  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  65.67 
 
 
212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0494  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  64.71 
 
 
221 aa  270  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0448  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  60.59 
 
 
220 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3294  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  55.44 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0698119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2507  nucleoside phosphorylase-like protein  35.96 
 
 
195 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3254  nucleosidase, putative  35.84 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0367638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2641  nucleoside phosphorylase-like protein  34.68 
 
 
195 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345305  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  33.33 
 
 
200 aa  89  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2657  nucleoside phosphorylase-like protein  35.4 
 
 
196 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3241  nucleoside phosphorylase-like protein  32.09 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3067  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.15 
 
 
184 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.418066  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3696  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.25 
 
 
186 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1473  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000544933  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0246  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.38 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0670161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0227  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.38 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0230  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.38 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.632822  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0244  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.38 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0228  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.38 
 
 
232 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.819967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.64 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0699  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.18 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.66 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.52 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.04 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  27.69 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.84 
 
 
233 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2130  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.95 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.343593  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.47 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.47 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2188  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.63 
 
 
231 aa  52  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0151  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3500  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0169  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0171  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3443  Adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0164  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00157  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00158  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.94081  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0163  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
232 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.93 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.93 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0882  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.95 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  31.38 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3454  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.91 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3325  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.91 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.93 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.31 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  28.49 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  23.83 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0989  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.91 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.223188  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4493  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.71 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0787  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.91 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.275653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.24 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17250  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.4 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3086  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0528  MTA/SAH nucleosidase  23.81 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0176375  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.06 
 
 
240 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671323  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4456  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.29 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4270  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.29 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4118  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.29 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4602  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.29 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0920  methylthioadenosine nucleosidase  27.98 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.103571  normal  0.199086 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4454  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.29 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0743  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.29 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0377  putative nucleosidase, Pfs protein  23.98 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4507  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.29 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0977  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.23 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1192  nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0527  MTA/SAH nucleosidase  23.62 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.148978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4107  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.71 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4221  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.71 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4743  MTA/SAH nucleosidase  30.15 
 
 
243 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1027  methylthioadenosine nucleosidase  24.05 
 
 
230 aa  41.6  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1001  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.22 
 
 
230 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2476  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.13 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1217  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.84 
 
 
230 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0451567 
 
 
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