65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2414 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  45.3 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  43.4 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  40 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  38.86 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  33.7 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  28.88 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  32.28 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  30.19 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  29.69 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  29.68 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  31.18 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2641  nucleoside phosphorylase-like protein  29.61 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345305  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2507  nucleoside phosphorylase-like protein  31.28 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3254  nucleosidase, putative  31.28 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0367638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  28.65 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2657  nucleoside phosphorylase-like protein  32.2 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  27.72 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  28.8 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  29.83 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  44.16 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  27.32 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3241  nucleoside phosphorylase-like protein  27.87 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  29.23 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  29.73 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  35.19 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  42.31 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.35 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  41.56 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  35.1 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.27 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.27 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  27.39 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  45.07 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  27.93 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0400  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3518  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.41 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.68 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.17 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  41.03 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  44.62 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.54 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4572  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.49 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4309  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.05 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.54 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0205  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.04 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0223  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.12 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172084  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_002950  PG0497  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.65 
 
 		 228 aa  45.4  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.36672 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.69 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0112  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.12 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.69 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0152  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.12 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00286407  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0327  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.61 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0360  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.61 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.459155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  21.39 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0124  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.58 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0287728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2560  MTA/SAH nucleosidase  22.91 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.04 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0526  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.04 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4313  adenosylhomocysteine nucleosidase  47.73 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.07 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.4 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3294  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.66 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0698119  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1515  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.32 
 
 		 228 aa  42  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.266051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>