45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0106 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  472  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  44.59 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  43.64 
 
 
235 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  43.66 
 
 
215 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  48.7 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  41.7 
 
 
204 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  35.4 
 
 
387 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  44.08 
 
 
216 aa  99  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  44.19 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  34.71 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  44.57 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  33.33 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  36.41 
 
 
242 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  35.87 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  35.68 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  35.09 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  34.66 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  32.8 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  41.98 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  50 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  32.51 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  33.02 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  31.32 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  32.77 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  27.51 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  30.71 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  33.05 
 
 
252 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  30.47 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  31.84 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  29.15 
 
 
252 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2188  Adenosylhomocysteine nucleosidase  23.86 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.01 
 
 
233 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3198  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.77 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  32.39 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1589  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.28 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.7 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  28.96 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2050  methylthioadenosine nucleosidase  27.98 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00216128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1338  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.59 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7561  Nucleoside phosphorylase-like protein  35.51 
 
 
296 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0497  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.87 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.36672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.89 
 
 
235 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4034  purine or other phosphorylase family 1  28.35 
 
 
302 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>