32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0209 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  58.9 
 
 
253 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  55.93 
 
 
239 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  43.4 
 
 
252 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  39.11 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  39.06 
 
 
258 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  31.34 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  26.05 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  30.38 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  28.81 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  34.97 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  30 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  30.93 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  31.35 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  41.18 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  28.33 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  27.12 
 
 
255 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  26.61 
 
 
210 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  26.89 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  29.52 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  25.53 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  35.37 
 
 
387 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  27.95 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  29.53 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  30.27 
 
 
222 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  36.59 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2641  nucleoside phosphorylase-like protein  28.72 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345305  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.09 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2507  nucleoside phosphorylase-like protein  29.1 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3254  nucleosidase, putative  28.72 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0367638  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.09 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  24.35 
 
 
200 aa  42  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>