34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3009 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  41.36 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  42.22 
 
 
253 aa  134  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  38.25 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  39.11 
 
 
236 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  38.86 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  33.66 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  33.16 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  32.91 
 
 
204 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  32.47 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  34.03 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  29.44 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  32.97 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  29.07 
 
 
298 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  32.98 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  42.86 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  33.33 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  34.55 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  31.25 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  44.16 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  32.29 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  27.85 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  41.98 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  27.04 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  29.8 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  48.53 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  30.96 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  26.34 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  32.12 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0377  putative nucleosidase, Pfs protein  24.04 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  28.19 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1192  nucleoside phosphorylase  28.02 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.47 
 
 
227 aa  42  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>