36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2491 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
239 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  59.92 
 
 
253 aa  279  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  55.93 
 
 
236 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  45.3 
 
 
252 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  41.36 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  40.5 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  29.18 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  32.63 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  32.77 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  29.09 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  27.46 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  33.74 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  34.97 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  30.41 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  28.72 
 
 
255 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  30.04 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  29.9 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  26.01 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  30.84 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  28.95 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  31.33 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  28.49 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  29.35 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  39.19 
 
 
387 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3241  nucleoside phosphorylase-like protein  24.43 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.13 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  40.54 
 
 
313 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  32.43 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  40.85 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  30.91 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  27.96 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.71 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  44.44 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.08 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2641  nucleoside phosphorylase-like protein  30.16 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345305  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2657  nucleoside phosphorylase-like protein  27.13 
 
 
196 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>