43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3188 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  59.92 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  58.9 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  42.86 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  42.22 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  34.47 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  31.54 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  30.8 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  27.43 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  30.45 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  35.76 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  32.78 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  33.5 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  35.58 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  32.02 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  32 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  31.72 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  28.9 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  27.66 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  31.35 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  31.53 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  30.37 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  32.77 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  30.13 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  40.24 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  30.5 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  40.24 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  34.78 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  29.32 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0223  Adenosylhomocysteine nucleosidase  28.72 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172084  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3241  nucleoside phosphorylase-like protein  23.84 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  32.07 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.58 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.13 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  32.19 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  31.51 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2657  nucleoside phosphorylase-like protein  26.16 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2507  nucleoside phosphorylase-like protein  26.74 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3254  nucleosidase, putative  26.74 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0367638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.41 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.15 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0606  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.6 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>