57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0261 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  69.95 
 
 		 235 aa  277  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  71.7 
 
 		 234 aa  271  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  52.74 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  45.07 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  51.22 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  41 
 
 		 313 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  50.49 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  49.5 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  38.5 
 
 		 387 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  49.28 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  39.44 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  36.73 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  28.7 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  33.7 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  31.95 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  30.18 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  34.39 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  34.83 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  34.87 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  32.67 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  27.23 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  37.04 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  33.18 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  28.93 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.14 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  32.11 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  31.05 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.45 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1473  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.6 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  45.07 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  44.07 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.04 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  29.18 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.86 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0977  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.86 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.28 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26221  predicted protein  29.52 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193959  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0953  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.15 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.84 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2130  adenosylhomocysteine nucleosidase  23.93 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.343593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  29.41 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.24 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.16 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.84 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.16 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  20.5 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1299  MTA/SAH nucleosidase  36.9 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0016425  hitchhiker  0.0031404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0765  MTA/SAH nucleosidase  28.48 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0961162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  20.45 
 
 		 253 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2476  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.15 
 
 		 232 aa  42  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0377  putative nucleosidase, Pfs protein  20.71 
 
 		 237 aa  42  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0602  methylthioadenosine nucleosidase  23.23 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0855  adenosylhomocysteine nucleosidase  23.72 
 
 		 251 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.391671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>