76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3518 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3518  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0328  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  73.56 
 
 		 212 aa  315  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4309  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  71.15 
 
 		 212 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4572  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  70.19 
 
 		 212 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0494  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  65.05 
 
 		 221 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2777  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  65.09 
 
 		 212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0327  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  66.67 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0360  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  66.67 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.459155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3057  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  67.65 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0448  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  64.04 
 
 		 220 aa  252  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3294  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  54.17 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0698119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2641  nucleoside phosphorylase-like protein  32.04 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345305  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3241  nucleoside phosphorylase-like protein  31.67 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2507  nucleoside phosphorylase-like protein  32.6 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3254  nucleosidase, putative  32.6 
 
 		 217 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0367638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0543  purine or other phosphorylase family 1  30.81 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2657  nucleoside phosphorylase-like protein  28.57 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3696  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  32.22 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3067  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.44 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.418066  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1473  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.17 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000544933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.94 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  30.51 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  30.51 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.37 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2130  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.22 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.343593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.38 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.05 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  27.84 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0227  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.98 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0246  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.98 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0670161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0230  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.98 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.632822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0228  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.98 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.819967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0244  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.98 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.63 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.63 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0787  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.17 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.275653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0699  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11070  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.93 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0308567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0169  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0151  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00157  hypothetical protein  26.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3443  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0171  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3500  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0164  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0163  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00158  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.94081  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2188  Adenosylhomocysteine nucleosidase  28.88 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  30.41 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3454  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.26 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.63 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3325  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.26 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0882  5'-methylthioadenosine nucleosidase / S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.78 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0989  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.26 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.223188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.07 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0698  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.22 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.38 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0977  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.9 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0377  putative nucleosidase, Pfs protein  22.99 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.21 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.74 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2050  methylthioadenosine nucleosidase  27.04 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00216128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2476  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.4 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  31.33 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17250  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.71 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  29.38 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0855  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.33 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4313  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.08 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0400  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.6 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.67 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1299  MTA/SAH nucleosidase  33.54 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0016425  hitchhiker  0.0031404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2874  methylthioadenosine nucleosidase  23.39 
 
 		 236 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.00179592 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1192  nucleoside phosphorylase  27.57 
 
 		 233 aa  42  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4743  MTA/SAH nucleosidase  28.29 
 
 		 243 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0706  methylthioadenosine nucleosidase  28.67 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.427184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>