More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0214 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  244  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  94.83 
 
 		 117 aa  194  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  62.71 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  57.89 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  59.22 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  50.88 
 
 		 191 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  75.79 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  47.71 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  51.43 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  51.43 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.57 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  54.08 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  46.6 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  46.73 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  46.6 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  46.6 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  50.56 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  45.63 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  51.06 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  48.94 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  42.61 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  45.63 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  44.12 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  46.6 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  42.52 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  48 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  56.04 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  46.3 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  42.72 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  43.14 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  56.57 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  44.79 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  56.57 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  56.57 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  53.41 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  45.63 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  48.86 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  40.59 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  42.72 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  43.16 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  45.54 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  44.33 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  57.45 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  43.14 
 
 		 111 aa  83.6  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  46.39 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  48.48 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  47.42 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  39.42 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  42 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  54.26 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  40.2 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  57.14 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  44.76 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  45.45 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  44.21 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  43.62 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  40.78 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  45.92 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  44.9 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  43.88 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0478  hypothetical protein  58.06 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0000618087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  44.9 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  42.42 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  42 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  47 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  40.95 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  47.47 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  48.61 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  44.94 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  44.09 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  41.75 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  44.33 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  39.29 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  43.96 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  43.96 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  43.96 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  43.96 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  44.66 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  43.96 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  43.96 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>