More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4009 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  183  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  50 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  48.81 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  58.11 
 
 		 115 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  53.42 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  41.49 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  57.75 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  44.09 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  57.75 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  57.75 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  44.79 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  49.47 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  46.59 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  50.55 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  46.67 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  41.49 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.55 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  40.62 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  42.55 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  45.45 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  46.67 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  43.82 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  43.62 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  42.55 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  51.32 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.55 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  42.55 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  43.01 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  39.13 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  43.48 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  41.76 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  41.94 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  44.19 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  41.49 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  41.49 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.43 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  46.43 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  41.05 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  53.52 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  39.36 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  38.3 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  52.11 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  41.49 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  39.78 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  43.01 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1560  hypothetical protein  44.19 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  49.35 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  48.05 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1548  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0355812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  48.05 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  41.94 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  39.56 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  49.35 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  41.49 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  39.36 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  38.71 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  40.74 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  45.74 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  36.56 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0045  hypothetical protein  50.67 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  41.76 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  38.54 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  37.23 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  41.3 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  42.39 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  38.71 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  47.31 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  41.41 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  40.66 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  43.01 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  35.16 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  46.75 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  41.3 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  41.3 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1999  hypothetical protein  43.24 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0436  hypothetical protein  60 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  34.04 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  36.17 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  35.11 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  35.11 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>