More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1287 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  207  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  93.62 
 
 
110 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  90.91 
 
 
110 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  90.91 
 
 
110 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  90.91 
 
 
110 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  55.56 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  57.27 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  72.97 
 
 
127 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  54.74 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  55.79 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  47.37 
 
 
191 aa  97.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  55.32 
 
 
96 aa  97.1  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  54.55 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  50.49 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  45.54 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  44.12 
 
 
100 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  39.09 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  40.74 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  40.74 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  41.82 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  39.81 
 
 
115 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  44.23 
 
 
103 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  39.81 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  55.56 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  41.75 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  46.88 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  46.88 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  46.88 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  39.81 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  48.81 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  44.86 
 
 
109 aa  80.1  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  40.38 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  41 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  45.83 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  46.81 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  41.41 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  41.41 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  40.2 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  40.43 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  38.38 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  46.24 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  36.45 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  37.86 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  40.78 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0478  hypothetical protein  61.05 
 
 
111 aa  77  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0000618087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  44 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  41.18 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  44.68 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  44.68 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  48.15 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  41.41 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.86 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  37.04 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  41 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  37.25 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  40.78 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  40.78 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  38.1 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  34.95 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  43.62 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1999  hypothetical protein  47.44 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  48.94 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  43.62 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  41.35 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  42.42 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  45.98 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  44 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  44.83 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  41.41 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  35.79 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  33.98 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  40.43 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  32.35 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  43.62 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1806  hypothetical protein  43.4 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.584307  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  40.78 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  33.01 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  40.59 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  40.78 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  34.51 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  36.89 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  39.56 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  41.41 
 
 
106 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  41 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  40.82 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  40.82 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  40.43 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  36.46 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  38 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  39 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  35.92 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>