More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3531 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  214  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  68.27 
 
 
119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9314  hypothetical protein  79 
 
 
117 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  60.4 
 
 
118 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  57.89 
 
 
156 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  56.76 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4815  hypothetical protein  57.28 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  53.85 
 
 
158 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  62.75 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  48.25 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  44.76 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  44.76 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0045  hypothetical protein  55.26 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  55.56 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  45.79 
 
 
191 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  41 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  39.6 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  42.27 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  40.78 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  36.54 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.37 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  39.45 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  43.3 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  39.45 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  39.8 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  38.89 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  35.64 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  54.05 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  38.32 
 
 
103 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  37.25 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  38.38 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  37.04 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  41.94 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  46.94 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  34.34 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  38.32 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  36.63 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  38.54 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  37 
 
 
99 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  48.75 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  35.35 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  36 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  48.75 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  41.38 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  37 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  39.81 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  40.19 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  45.45 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  37.76 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  38.38 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  41.67 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  37.5 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  38.38 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  41.51 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  37.76 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  35.51 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  40.24 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  40.24 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  34.23 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  37.76 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  39.02 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  39.02 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  39.02 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  39.02 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  39.02 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  39.02 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  39.02 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  40.24 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  33.64 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  41.98 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  41.18 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  38.1 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  36.45 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  37.38 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  39.77 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  44.74 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  37.96 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  36.36 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  44.74 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  44.74 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  37 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  38.1 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  37.14 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  37 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  36.45 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  36.08 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>