More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0478 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  213  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0000618087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  61.47 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  53.1 
 
 		 118 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  56.31 
 
 		 119 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  49.14 
 
 		 116 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  58.76 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  48.51 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  48.31 
 
 		 191 aa  100  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  52.94 
 
 		 100 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  53.92 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  65.66 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  65.66 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  65.66 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  43.64 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  42.73 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  42.73 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  44.14 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  43.27 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  49.48 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  42.73 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  62.11 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  44.23 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  38.18 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  52.13 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  44.76 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  45.63 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  41.35 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  45.1 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.38 
 
 		 102 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  51.11 
 
 		 158 aa  87  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  87  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  63.83 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  48.39 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  44.76 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  48.57 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  36.89 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  43.27 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  46.85 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  49.02 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  45.1 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  43 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  47.71 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  46.85 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  46.85 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  47.06 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  41.75 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  46.85 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  58.9 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  45.1 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  61.7 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.31 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  84.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  42.31 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  48.04 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  43.36 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  46.08 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  48.31 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  40.78 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  45 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  47.06 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  46.23 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  46.23 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  51.19 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  39.36 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  45.1 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  52.56 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  46.08 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  44.12 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  44.14 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  45.36 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  44.64 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  43.88 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1806  hypothetical protein  43.86 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.584307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  47.06 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  40.78 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  45.1 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  45.1 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  43.75 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  47.47 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  43.14 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  42.34 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  42.34 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  40.78 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  42.34 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  43.33 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  43.14 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  48.24 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  47.06 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  43.12 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  45.1 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  47.06 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  41.18 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>