More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0672 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  363  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  53.64 
 
 		 118 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  61.62 
 
 		 115 aa  94.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  43.43 
 
 		 112 aa  93.6  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  51.75 
 
 		 117 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  45.54 
 
 		 108 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.37 
 
 		 102 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  51.55 
 
 		 107 aa  88.6  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  45.36 
 
 		 103 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  49.45 
 
 		 104 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  48.96 
 
 		 119 aa  85.5  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  53.68 
 
 		 125 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  41.44 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  43 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  51.06 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  44.23 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  45.19 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  43.4 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  44.9 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  41.49 
 
 		 105 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  43.3 
 
 		 103 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  51.69 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  42.11 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  40.21 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  45.35 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  44.21 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.54 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  43.4 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  43.4 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  40.66 
 
 		 100 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  45.16 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  45.16 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  39.64 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  45.16 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  47.19 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  45.16 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  44.83 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.84 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  37.89 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  43.69 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  44.66 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  43.01 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  43.3 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  45.36 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  45.36 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  44.71 
 
 		 113 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  38.04 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  38.78 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  38.78 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  38.14 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  41.18 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  42.27 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  37.62 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  39.42 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  44.57 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  40.35 
 
 		 106 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  41.58 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  38.54 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  72  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  51.69 
 
 		 110 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  40.91 
 
 		 105 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  48.35 
 
 		 104 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  43.48 
 
 		 106 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  44.3 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  40.66 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  39.56 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  43.18 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  42.31 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  42.31 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  41.76 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  42.31 
 
 		 109 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  46.99 
 
 		 114 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  51.69 
 
 		 110 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  39.56 
 
 		 107 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  39.56 
 
 		 109 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  43.3 
 
 		 107 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  42 
 
 		 114 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  39.56 
 
 		 107 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  41.03 
 
 		 109 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0256  hypothetical protein  54.55 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  41.76 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  48.61 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  41.03 
 
 		 109 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  41.24 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  41.03 
 
 		 109 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  38 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  41.76 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  36.89 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>