More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2292 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  203  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  95 
 
 
100 aa  197  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  58.95 
 
 
99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  56.44 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  57.14 
 
 
108 aa  105  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  63.29 
 
 
100 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  48.6 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  46 
 
 
104 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  47.83 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  48.35 
 
 
105 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  46 
 
 
103 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  47.83 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  43.56 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  44.55 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  46.53 
 
 
113 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  56.1 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  56.1 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  55.56 
 
 
108 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  44.33 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  45.54 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.59 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  46.74 
 
 
104 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1512  hypothetical protein  46 
 
 
171 aa  86.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00457578  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  52.44 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  41.24 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  52.44 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  41.3 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  42 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  42 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  48.81 
 
 
96 aa  84.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  40.22 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  42.39 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  40.59 
 
 
111 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  38.61 
 
 
102 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  43.48 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  45.35 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  58.33 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  41.12 
 
 
116 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  43.48 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  58.33 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  47.57 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  58.33 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  40.82 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  39.6 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  40.62 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  41.84 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  43.88 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  49.38 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  45.16 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  53.42 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.62 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  40.22 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  41.41 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  41.41 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  47.06 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  41.41 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  51.76 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  43.3 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  40.4 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  43.48 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  43.69 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  38.14 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  45.68 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  45.68 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  45.45 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  51.39 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  44.57 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  37.11 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  37.11 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  53.52 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  40.22 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1379  hypothetical protein  45.26 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.370164  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  43.48 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  38.89 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  40.43 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  37.25 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  36.08 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  40.21 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  42.27 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  36.96 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  36.96 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  42.39 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  53.52 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  39.13 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  44.57 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>