More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0017 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  94.44 
 
 
108 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  87.8 
 
 
109 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  87.8 
 
 
109 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  86.59 
 
 
109 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  86.59 
 
 
109 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  86.59 
 
 
109 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  86.59 
 
 
109 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  86.59 
 
 
109 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  86.59 
 
 
109 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  86.59 
 
 
109 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  84.15 
 
 
109 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  84.71 
 
 
109 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  60.18 
 
 
113 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  65.05 
 
 
103 aa  127  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  61.76 
 
 
104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  57.28 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  59.8 
 
 
115 aa  124  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  58.59 
 
 
101 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  57.43 
 
 
102 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  59.57 
 
 
105 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  55.34 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  51.89 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  66.98 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  53.27 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  53.15 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  57.89 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  66.04 
 
 
105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  52.38 
 
 
112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  52.38 
 
 
112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  54.21 
 
 
104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  66.04 
 
 
105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  53.06 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  51 
 
 
102 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  54 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  49 
 
 
100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  55.67 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  55 
 
 
104 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  55 
 
 
104 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  48.48 
 
 
99 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  57.14 
 
 
100 aa  105  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  49.5 
 
 
102 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  49.51 
 
 
103 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  56.12 
 
 
100 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  55.45 
 
 
104 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  52.63 
 
 
113 aa  102  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  49.52 
 
 
113 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  50.98 
 
 
119 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  51.02 
 
 
99 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  59.52 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  47.32 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  45.79 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  59.38 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  44 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  45.92 
 
 
191 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  49.04 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  57.73 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  55.95 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  48.54 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  45.19 
 
 
102 aa  91.3  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  47.67 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  45.37 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  46.3 
 
 
107 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  45.37 
 
 
107 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  45.37 
 
 
107 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  44.86 
 
 
107 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  55.67 
 
 
104 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  40.2 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  46.15 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  42.45 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  42.45 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  47.06 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  44.44 
 
 
118 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  44.33 
 
 
99 aa  87.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  43.52 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  47.92 
 
 
156 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  41 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  46.46 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  41 
 
 
103 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  44.76 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  43.4 
 
 
109 aa  84.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  49.04 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  43.52 
 
 
109 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  45.54 
 
 
107 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1512  hypothetical protein  51 
 
 
171 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00457578  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  43.64 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  43.81 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  40.78 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2803  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2672  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  44.23 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  42.45 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  44.76 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  42.45 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>