More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6386 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  216  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  58.33 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  54.29 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  49.47 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  42.45 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  47.06 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  46.08 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  44.79 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  41.84 
 
 		 118 aa  83.6  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  40.37 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  42.73 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  45.45 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  40.37 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  42.72 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  40.62 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  42.73 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  39.58 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  39.09 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  45.92 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  45.74 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  40.78 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  40.7 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  42.73 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  43.68 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  43.64 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  37.86 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  44.68 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1999  hypothetical protein  53.57 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  47.62 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  38.54 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  40.59 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  42.31 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  41.82 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  41.82 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  40.91 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  41.82 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  39.05 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.83 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  41.67 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  40.91 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  38.95 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  39 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  39.22 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  36.54 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3058  hypothetical protein  46.75 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2890  hypothetical protein  46.75 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  41.05 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  41.9 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  40.57 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  38.38 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3197  hypothetical protein  46.75 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  41.82 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  50.68 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  50.68 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  43.01 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  36.08 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>