More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0801 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  206  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  76.92 
 
 
104 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  70.19 
 
 
104 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  70.19 
 
 
104 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  67.31 
 
 
104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  65.38 
 
 
104 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  72.12 
 
 
104 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  55.77 
 
 
104 aa  120  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  66.35 
 
 
104 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  54.46 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  56 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  55.88 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  53.85 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  52.43 
 
 
110 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  51.96 
 
 
103 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  50.51 
 
 
99 aa  106  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  50.44 
 
 
113 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  48 
 
 
100 aa  103  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  55.45 
 
 
108 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  48.45 
 
 
102 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  47.75 
 
 
111 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  50.5 
 
 
115 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  45.1 
 
 
103 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  49.48 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  51.46 
 
 
98 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  47.62 
 
 
105 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  52.63 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  47 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  46.08 
 
 
103 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  55.21 
 
 
110 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  48.94 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  43.14 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  45.63 
 
 
112 aa  90.9  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  57.83 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  49.44 
 
 
99 aa  90.1  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  42.27 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  48.42 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  47.73 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  53.57 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  53.57 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  42.27 
 
 
101 aa  85.5  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  53.57 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  41.18 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  48.19 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  42 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  42.71 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.4 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  42.71 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  41.67 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  49.38 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  38.38 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2768  hypothetical protein  43.81 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  45.24 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  38 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  38.68 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  38.68 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  41.18 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  38.68 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  40.2 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  37.76 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  42.71 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  42.39 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  38.68 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  39.8 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  38.78 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  43.48 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  38.78 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  38.78 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  40.59 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  38.24 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  38.24 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  40.2 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  35.58 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  38.24 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>