More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2146 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  67.96 
 
 		 103 aa  151  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  64.08 
 
 		 103 aa  139  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  54.37 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  52 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  52.48 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  51.49 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  51 
 
 		 102 aa  104  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  50.5 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  46.6 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  48.04 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  50.51 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  48.51 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  49 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  51.06 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  46.08 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  55.81 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  48.04 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  49.02 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  47 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  46.08 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  50.98 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  42.57 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  46.08 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  44.79 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  43.56 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  40.78 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  40.78 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  44.55 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  45.26 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  44.55 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  42.11 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  42.16 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  42.16 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  39 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  49.47 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  40.78 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  38.14 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  40.59 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  41.24 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  41.24 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  42.27 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  42.27 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  42.27 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  35.35 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  35.35 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  41.24 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  41.24 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  42.27 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  47.67 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  41.49 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  40.21 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  40.21 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  42.06 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  41 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  38 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  40.21 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.74 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  40.62 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  38 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  46.88 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  42.39 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>