More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  100 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  71.29 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  72.63 
 
 		 113 aa  136  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  55.88 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  54.9 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  56.7 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  53 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  51.96 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  55.67 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  51.96 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  53.06 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  49 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  49.5 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  50.98 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  49.02 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  49.5 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  52.58 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  47.47 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  51.02 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  53.19 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  48.45 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  48 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  50.52 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  46.53 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  45.1 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  55.67 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  60.76 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  49.5 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  55.67 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  48.51 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  47 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  51.72 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  51 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  47.87 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  45.26 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  51.76 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  45.1 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  54.17 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  43.56 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  44 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  49.41 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  49.41 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  41.41 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  43.96 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  45.79 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  49.4 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  44.09 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  49.4 
 
 		 108 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  39.6 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  39.6 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  45.45 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  37.76 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  39.6 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  41.84 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  37.62 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  41.84 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  41.84 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  39.36 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  40.59 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  42.55 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  39.6 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  49.38 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.44 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  40.59 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  39.18 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  40.82 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  40.54 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  54.41 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  44.09 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  41.24 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  37.63 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  40.21 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  41.24 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  41.24 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>