More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0541 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  66.34 
 
 
104 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  61.39 
 
 
102 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  63.73 
 
 
104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  59.41 
 
 
102 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  65.05 
 
 
108 aa  127  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  62.89 
 
 
102 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  63.83 
 
 
105 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  59.8 
 
 
104 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  56.31 
 
 
103 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  59.22 
 
 
103 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  60.4 
 
 
111 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  59.8 
 
 
104 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  55.56 
 
 
99 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  58.82 
 
 
104 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  58.82 
 
 
113 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  60.92 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  51 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  56.86 
 
 
104 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  52.48 
 
 
112 aa  114  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  56.86 
 
 
104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  55.88 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  66.67 
 
 
109 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  66.67 
 
 
109 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  65.48 
 
 
109 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  65.48 
 
 
109 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  65.48 
 
 
109 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  65.48 
 
 
109 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  65.48 
 
 
109 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  65.48 
 
 
109 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  65.48 
 
 
109 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  51.96 
 
 
111 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  56.84 
 
 
113 aa  110  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  51.96 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  51.46 
 
 
103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  64.29 
 
 
109 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  65.85 
 
 
108 aa  105  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  52.43 
 
 
112 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  52.43 
 
 
112 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  49.5 
 
 
105 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  63.41 
 
 
109 aa  104  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  46.6 
 
 
103 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  52.13 
 
 
99 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  49.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  44.66 
 
 
103 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  58.82 
 
 
104 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  48 
 
 
101 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  50.5 
 
 
127 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  56.86 
 
 
104 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  46.23 
 
 
112 aa  99  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  49.5 
 
 
102 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  47.52 
 
 
113 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  59.38 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  48 
 
 
98 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  46 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  47.83 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  48.91 
 
 
100 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  44.79 
 
 
103 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  44 
 
 
107 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  42.71 
 
 
103 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  45.83 
 
 
103 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  53.09 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  43.75 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  45 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  47.25 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  45.36 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  50.62 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  50.62 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  51.81 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  44.9 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  44.66 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  42.42 
 
 
107 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  42.42 
 
 
107 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  45 
 
 
111 aa  84  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  45.05 
 
 
158 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  53.85 
 
 
100 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  43.3 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  45.65 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  41 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  43.88 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  42.86 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  43.3 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  42 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  43.3 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  45.16 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  42 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  42 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  42 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  43.3 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  41.58 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  42.27 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  39.18 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  46.32 
 
 
119 aa  77  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>