More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2143 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  75.49 
 
 
115 aa  166  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  64.6 
 
 
111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  62.61 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  55.75 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  55.75 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  60.18 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  60.95 
 
 
104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  62.38 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  65.26 
 
 
105 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  60.78 
 
 
102 aa  124  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  56.64 
 
 
104 aa  120  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  56.44 
 
 
100 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  58.82 
 
 
103 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  51.43 
 
 
105 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  56 
 
 
99 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  58.16 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  54.9 
 
 
119 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  56.57 
 
 
104 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  56.12 
 
 
102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  51.33 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  49.56 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  56.44 
 
 
104 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  56.44 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  63.27 
 
 
104 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  56.57 
 
 
104 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  51.49 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  52.48 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  51.96 
 
 
102 aa  107  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  54.37 
 
 
110 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  50.44 
 
 
104 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  57.29 
 
 
113 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  64.29 
 
 
104 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  62.89 
 
 
110 aa  103  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  62.65 
 
 
108 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  54.46 
 
 
98 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  61.22 
 
 
104 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  58.82 
 
 
109 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  58.82 
 
 
109 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  56.47 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  48.04 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  47.96 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  46.53 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  49.02 
 
 
103 aa  95.9  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  56.47 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  49.47 
 
 
99 aa  94.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  57.83 
 
 
113 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  45.54 
 
 
103 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  48 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  56.1 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  46.53 
 
 
100 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  42.61 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  51.85 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  47.52 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  43.4 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  45.22 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  45.36 
 
 
104 aa  87.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  44.55 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  53.66 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  42.57 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  53.66 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  42.57 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  47.25 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  45 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  40.2 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  43.56 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  40.2 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  44.55 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  43.56 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  40.2 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  44.23 
 
 
191 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  40.38 
 
 
115 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  41.9 
 
 
109 aa  84  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  42.11 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  42.11 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  42.11 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  42.71 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  43.14 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  41.35 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  40.59 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  41.35 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  41.58 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.1 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  40.2 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>