More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0095 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  204  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  80.77 
 
 		 104 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  78.85 
 
 		 104 aa  170  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  79.81 
 
 		 104 aa  168  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  79.81 
 
 		 104 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  88.46 
 
 		 104 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  76.92 
 
 		 104 aa  144  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  65.38 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  67.31 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  68.09 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  61.86 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  60.58 
 
 		 104 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  60.82 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  57.73 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  55.88 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  58.82 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  56.25 
 
 		 99 aa  117  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  58.16 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  53.4 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  56.7 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  53.47 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  54.64 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  54.64 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  54.64 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  52.04 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  56.7 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  48.04 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  55.67 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  51.55 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  63.54 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  56.84 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  56.18 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  51.52 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  48.04 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  49 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  44.12 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  52.33 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  58.54 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  48.96 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  49.48 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  45.36 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  49 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  55.42 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  54.22 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  47.87 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  54.22 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  53.01 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  53.01 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  53.01 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  53.01 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  53.01 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  53.01 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  53.01 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  51.14 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  52.33 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2768  hypothetical protein  47.62 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  41.75 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  41.75 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  52.13 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  54.22 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  45.16 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  40.38 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  43.48 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  44.57 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  54.55 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  42.72 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  48.81 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  46.15 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  42.27 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  40.2 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  53.52 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  53.52 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  40.2 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  42.16 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  40.59 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  45.19 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  38.61 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  41.58 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  39.8 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>