More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0188 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  203  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  67.96 
 
 		 103 aa  151  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  66.99 
 
 		 103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  54.37 
 
 		 103 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  51 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  50 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  50.5 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  49.49 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  48 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  51.52 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  51.55 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  44.66 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  48 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  54.02 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  48.94 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  42.16 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  48 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  47.52 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  51.04 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  44 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  42 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  45.54 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  45.54 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  43.14 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  44 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  39.6 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  42.42 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  36.89 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  36.89 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  39.18 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  40.82 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  42.16 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  47.25 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  41.84 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  38.78 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  41.84 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  41.84 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  40.82 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  44.19 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  41.84 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  40.82 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  40.82 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  37.76 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  40.62 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  38.14 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  40.82 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  44.68 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  40.82 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  40.82 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  42.42 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  38.78 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  41.84 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  36.45 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  39.36 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  40.43 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  39.36 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  39.36 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  38.3 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>