283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1512 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1512  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  350  7e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00457578  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  51 
 
 
108 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  46 
 
 
100 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  47 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1379  hypothetical protein  58.33 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.370164  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  48 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  45.45 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  46.53 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  45.54 
 
 
102 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  45.83 
 
 
107 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  53.09 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  46.88 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  45 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.57 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  50.6 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  50.6 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  49.4 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  51.85 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  49.4 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  49.4 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  49.4 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  49.4 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  49.4 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  49.4 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1154  hypothetical protein  56.7 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.307192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  39.39 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  50.6 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  43 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  38.24 
 
 
112 aa  72  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  40.82 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  43.75 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  44.9 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  49.4 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  43 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  41.24 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  48.19 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  39.6 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  43 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  43 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  44.66 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  47.56 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  42.45 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  43.56 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  45.36 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  44.66 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  45.36 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  43.75 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  44.09 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  39.25 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  48.15 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  42.57 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  42.71 
 
 
104 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  42.72 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  46.91 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  42.72 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  46.91 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  41.58 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  43.88 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  41.84 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  42.53 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  40.59 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  36.75 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  41.84 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  45.54 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.1 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  39.22 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  40.59 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  38.24 
 
 
111 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  44.71 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.6 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  40.59 
 
 
103 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  44 
 
 
108 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  37.37 
 
 
103 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  44.09 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  45.92 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  32.67 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  39.58 
 
 
104 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  42.72 
 
 
117 aa  62  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  39.22 
 
 
104 aa  62  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0478  hypothetical protein  60 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0000618087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  44.05 
 
 
104 aa  61.6  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  38.3 
 
 
107 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  44.76 
 
 
104 aa  61.2  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  50.56 
 
 
96 aa  61.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  37.89 
 
 
110 aa  61.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  43.56 
 
 
103 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  35.64 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>