292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6565 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  284  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  69.72 
 
 
158 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  58.18 
 
 
118 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  57.29 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  47 
 
 
112 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  47 
 
 
112 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  50.53 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  48 
 
 
108 aa  90.5  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  50.98 
 
 
191 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  44.33 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  50.45 
 
 
117 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  44.44 
 
 
112 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  67.61 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  45.92 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  46.74 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  49.57 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  44.79 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  44.55 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  46.88 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  47.37 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  40.57 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  44.33 
 
 
115 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  84  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  54.74 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  46.46 
 
 
112 aa  83.6  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  45.26 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  41.05 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  53.54 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  46.32 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  46.74 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  45.26 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  44.09 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  58.44 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  43.75 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9314  hypothetical protein  59.21 
 
 
117 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  43.75 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  44.44 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  45.05 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  42.7 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  51.28 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  41.67 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  41.67 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  38.95 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  46.91 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  48.81 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  41.49 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  49.35 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  42.53 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  39.36 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  38.95 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  48.05 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  48.05 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  42.31 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  47.44 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  48.61 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  38.89 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.5 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  40.66 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  46.15 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  45.45 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  46.15 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  45.45 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  40.43 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  44.87 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  44.87 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  44.87 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  44.87 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  44.87 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  44.87 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  37.04 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  44.87 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  40.22 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  43.18 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4815  hypothetical protein  48.65 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  33.68 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  39.58 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  42.71 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  47.83 
 
 
104 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  39.58 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  43.43 
 
 
113 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  41.05 
 
 
103 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  43.48 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  47.25 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  37.89 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  41.24 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  43.48 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1512  hypothetical protein  51.95 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00457578  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  38.54 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  43.59 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  38.54 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1446  hypothetical protein  34.21 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>