More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4815 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4815  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  226  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  61.54 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  52.54 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0045  hypothetical protein  69.23 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  55.83 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9314  hypothetical protein  58.25 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  44.54 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  46.88 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  46.43 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  41.35 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  53.7 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.32 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  39.67 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  45.92 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  43.64 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  43.64 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  40.19 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  40.71 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  38.74 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  38.74 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  42.61 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  31.25 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  33.03 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  33.96 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  41.82 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  41.23 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  41.23 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  34 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  36.84 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  40.35 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  43.12 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  42.73 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  44.66 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  40.35 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  40.35 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  40.35 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  39.82 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  39.05 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  40.35 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  39.45 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  37.38 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  37.38 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  41.82 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  47.44 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  41.82 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  47.44 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  39.82 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  41.82 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  41.82 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  39.82 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  41.82 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  36.45 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  41.82 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  39.82 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  41.41 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  36.75 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  34.29 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  39.82 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  36.54 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  43.16 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  41.28 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  41.28 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  38.32 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  33.62 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  33.64 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  44.23 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  37.11 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  40.74 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  33.91 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0318  hypothetical protein  47.86 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  34.55 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1548  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0355812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  41.28 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  34.34 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  36.11 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  52.04 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  38.05 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  38.38 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  38.05 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  52.43 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  39.45 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  52.43 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>