More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0045 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  223  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  66.35 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  53.78 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4815  hypothetical protein  69.23 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  58.33 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  47.5 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  50.49 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  48.96 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  52.04 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  43.27 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  52.56 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9314  hypothetical protein  57.69 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.32 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  40.71 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  44.66 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  33.94 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  38.79 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  43.81 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  48.62 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  37.84 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  39.22 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  42.05 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  38.89 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  39.81 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  43.88 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  43.88 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  43.88 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  37.76 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  45.26 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  39.05 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  33.64 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  41.51 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  39.05 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  39.45 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  37.61 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  36.36 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  33.02 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  36.79 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  33.94 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  54.37 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  38.53 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  41.35 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  54.37 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  36.04 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  36.04 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  40.43 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  54.37 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  40.4 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  40.4 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  38.95 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  44.83 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  38.18 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  40.2 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  40.78 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  40.57 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  40.57 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  35.45 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  37.17 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  41.05 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  45.16 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  34.55 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  34.55 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  39.8 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  38.54 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  41.35 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  39.8 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  41.75 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  41.75 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  39.45 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  36.7 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  38.53 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  35.78 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  41.05 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  38.95 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  42.31 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0086  hypothetical protein  42.11 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.643504  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  40.78 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  32 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>