287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1548 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1548  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  186  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0355812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  43.01 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  43.16 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.11 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0620  hypothetical protein  45.45 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.961902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  36.84 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  38.78 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  37.63 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.63 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  43.01 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  41.57 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  37.63 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  39.02 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  39.36 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  40.86 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0086  hypothetical protein  39.53 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.643504  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  35.48 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  37.63 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  38.95 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  38.95 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  35.79 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0667  hypothetical protein  40.7 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  36.56 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  36.08 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  38.71 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  35.79 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  43.42 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  50.77 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  50.77 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  34.74 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  50.77 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  37.35 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  41.25 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  38.71 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  41.11 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  35.79 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  37.97 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  45.95 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  43.42 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  36.17 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  38.71 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  39.33 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  36.96 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  33.68 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  35.48 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  39.6 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  39.29 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  40.23 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  38.3 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  38.3 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  37.93 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  36.56 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  37.08 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  37.78 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  46.38 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  35.48 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  35.56 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  34.41 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  34.74 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  40.45 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  37.63 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  35.48 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  35.56 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  35.48 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  34.74 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  34.74 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>