More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4993 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  90.43 
 
 
110 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  88.66 
 
 
110 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  58.18 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  57.66 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  74.32 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  57.89 
 
 
100 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  58.51 
 
 
96 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  55.79 
 
 
100 aa  103  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  49.14 
 
 
116 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  56.57 
 
 
125 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  52.43 
 
 
119 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  49.49 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  49.02 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  45.61 
 
 
191 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  44.55 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  40.57 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  43.52 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  43.52 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  39.81 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  41.75 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  44.23 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  57 
 
 
115 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  43.27 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  43.69 
 
 
127 aa  84.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.83 
 
 
102 aa  84.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  39.25 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  46.88 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  40.4 
 
 
111 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  48 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  43.14 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  44.79 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  44.79 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  44.79 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  39.81 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.78 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  45.92 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  45.92 
 
 
109 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  43.75 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  45.1 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  47.62 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0478  hypothetical protein  64.21 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0000618087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  43.93 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  41.75 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  43 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  44.79 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  38.94 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  45.74 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  41.84 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  42.16 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  50.62 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  43.43 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  46.07 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  43 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  38.83 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  43.43 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  39 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  43.88 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  41.41 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  36.89 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  41.41 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  35.92 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  35.92 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  40.2 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  46.74 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  43.01 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  35.29 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  38.3 
 
 
105 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  44.68 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  41.49 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  41.58 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  37.86 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  41.58 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  41.49 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  39.56 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  39.56 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  38.54 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  40.59 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  40.66 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  40.66 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  40.66 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  40.66 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  40.66 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  41 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  40.66 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  43.33 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  40.66 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  42.11 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  40.66 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>