More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9028 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  240  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  58.12 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  59.38 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  56.38 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  47.27 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  47.27 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  58.33 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  66.67 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  51.33 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  44.57 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  50.51 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  55.43 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  42.31 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  41.94 
 
 		 99 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  44.68 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  52.43 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  41.82 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  40.78 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  54.46 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  43.56 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  47.31 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  44.55 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  45.16 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  36.27 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0318  hypothetical protein  48.15 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  46.43 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  44.57 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  46.32 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  41.94 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  45.16 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  47.25 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  43.88 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  39.39 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4815  hypothetical protein  53.54 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  45.35 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  42.11 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  41.11 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  41.49 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  39.78 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  40 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  42.55 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  44.19 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  42.55 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  43.36 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  43.68 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  41.49 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  37.89 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  39.8 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  40.86 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  43.18 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  46.24 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  46.67 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  40.43 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  39.78 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  41.05 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9314  hypothetical protein  55.13 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  40.43 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  46.67 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  41.76 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  35.92 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  47.37 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  40.66 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  37.08 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  37.23 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.86 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  38.2 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  35.14 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  37.17 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  32.98 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  40.43 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  44.16 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  38.3 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  37.23 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  38.94 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  44.16 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  39.36 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0045  hypothetical protein  45.33 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  39.36 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  37.86 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  37.86 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  37.86 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  44.16 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  46.07 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  37.93 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>