More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0202 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  219  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  69.72 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  74.26 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  58.56 
 
 		 191 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  75.79 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  63.11 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  55.14 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  64.13 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  62.96 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  57.95 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  54.26 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  43.14 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  52.81 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  49.47 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  46.88 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  48.48 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  48.48 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  43.56 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  49.47 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  50.54 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  60.55 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  45 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  44.12 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  42.57 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  48.48 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  45.26 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  54.76 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  44.79 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  49.44 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  43.62 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  42.55 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  57 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9314  hypothetical protein  60 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  57 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  47.25 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  57 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  47.83 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  42.11 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  43.18 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  42.71 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  42.55 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  52.05 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  47.31 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  48.91 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  44.79 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  45.16 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  41.05 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  46.74 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0045  hypothetical protein  50.67 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  42.42 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  40.62 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  50.55 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  41.84 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  41.84 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0478  hypothetical protein  60.44 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0000618087  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  42.11 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  44.79 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  38.54 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  46.59 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  45.83 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  44.79 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  45.74 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  38.95 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  41.05 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  45.83 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  39.8 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  45.05 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  40.62 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  46.25 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  43.56 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  40.62 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  37.62 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  39.8 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  38.04 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  41.49 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  39.58 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  40.66 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  42.05 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  41.67 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  39.58 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  47.44 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  39.56 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  38.3 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  39.56 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>