267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0318 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0318  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  238  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.83 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  41.82 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  43.27 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  39.81 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  39.81 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  44 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  34.75 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  37.38 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  45.45 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  48.15 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  36.54 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  35.92 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  42.27 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  34.75 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  35.51 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  36.19 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  40.87 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  42.37 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  34.91 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  36.89 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  36.19 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  35.24 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  34 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  43.68 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  35.85 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  41 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  41.18 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  35.85 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  37.61 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  37.61 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  38.24 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  32.67 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  33.98 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  40.48 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  38.24 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  39 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  33.98 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  36.7 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  39.22 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  37.25 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  34.91 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  40.7 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  39.22 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  33.96 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  39 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1512  hypothetical protein  40.71 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00457578  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  42.35 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  31.73 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  39.33 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  34.02 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  35.29 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  39.81 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  34.58 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  32.2 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  38.37 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  37.37 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  41.18 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  38.37 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  32.69 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  41.18 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  38.61 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  37.21 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  37.21 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  37.21 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  37.21 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  37.21 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  37.21 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  37.21 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  34.51 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  31.63 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  38.61 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  32 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  31 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  33.64 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  33.98 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  34.55 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  36.79 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  36.79 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  37.25 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  36.79 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>