More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0882 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  233  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  76.58 
 
 
111 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  71.17 
 
 
111 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  73.83 
 
 
109 aa  157  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  69.37 
 
 
111 aa  156  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  68.47 
 
 
111 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  66.67 
 
 
111 aa  152  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  46.23 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  46.23 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.37 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  51.06 
 
 
104 aa  87  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  43.4 
 
 
112 aa  87  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  49.45 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  44.55 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  48.98 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  41.84 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  52.13 
 
 
104 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  51.11 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  41.51 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  45.36 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  44.34 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  44.68 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  43.3 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  47.87 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  45.26 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  46.39 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  47.19 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  43.3 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  43.01 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  48.94 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  43 
 
 
111 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  41.05 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  43.62 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  41.24 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  38.95 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  38.95 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  37.89 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  40.21 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  39.18 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  35.45 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  40.21 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  51.06 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  44.32 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  40 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  44.09 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  37.63 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  42.05 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  40.21 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  43.82 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  35.48 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  37.63 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  40.22 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  38.71 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  43.01 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  42.7 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  41.94 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  39.36 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  39.36 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  41.05 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  47.87 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  39.56 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  39.36 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  39.36 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  43.01 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  38.3 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  39.36 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  39.36 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  39.36 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  38.3 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1974  hypothetical protein  45.16 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178453  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  39.36 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  42.27 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  39.36 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  36.45 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  38.04 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  38.2 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  35.51 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.55 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>