More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1179 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  215  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  76.58 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  71.17 
 
 		 111 aa  159  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  69.37 
 
 		 111 aa  157  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  70.09 
 
 		 109 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  68.47 
 
 		 111 aa  153  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  67.57 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  46.32 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  44.79 
 
 		 109 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  47.25 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  45.74 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  44.21 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  43.16 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  45.26 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  44.68 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  43.3 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  46.81 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  43.88 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  43.88 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  44.33 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  44.9 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  42.27 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  49.45 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.25 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  41.05 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  37.89 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  47.25 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  41.24 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  44.57 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  41.24 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  43.43 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  43.62 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  42.27 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  44.55 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  42.27 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  46.74 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  47.56 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  36.26 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  36.89 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  42.11 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  42.05 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.27 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  39.56 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  36.26 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  41.94 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  38.68 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  40.82 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  39.36 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  38.68 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  40.21 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  40.66 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  41.3 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  37.23 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  37.74 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  40.2 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  43.18 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  41.3 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  37.23 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  42.7 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  42.7 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  39.56 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  35.16 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.56 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  37.36 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  39.56 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  40.86 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  34.78 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  40.2 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  37.74 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  37.63 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  37.63 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  37.74 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>