More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1974 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1974  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  201  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178453  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  44.66 
 
 
111 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  44.66 
 
 
113 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.57 
 
 
102 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  42.2 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  48.19 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  43.62 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  39.39 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  46.99 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  44.87 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  39 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  44.58 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  42.31 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  48.19 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  40.59 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  41 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  46.99 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  40.38 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  38.61 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  45.12 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  44.32 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  45.78 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  40.59 
 
 
115 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  39.51 
 
 
101 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  44.32 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  39 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  37.04 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  37.04 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  45.12 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  43.37 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  39 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  45.78 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  44.58 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  45.78 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  45.45 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.57 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  39.22 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  41.46 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  40.78 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  46.74 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  41.41 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  38.61 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.59 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  42.17 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  37.5 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  42.5 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  37.37 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  37.37 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  41.41 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  40.78 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  54.1 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  37.11 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  40.74 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2803  hypothetical protein  38.16 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2672  hypothetical protein  38.16 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  36.08 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  41.98 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  41.98 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  36.08 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  36.36 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  54.24 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  32.65 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  40.2 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  33.66 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  35.71 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  40.2 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  40.22 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  36.25 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  42.55 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  38.14 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  36.63 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  34.29 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>