More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4005 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  58.33 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  55.14 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  42.71 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  42.72 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  40.57 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  40.95 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  42.2 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  42.06 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  41.84 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  40.82 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  38.61 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  39.05 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  46.08 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  42.59 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  37.84 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.22 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  44.57 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  41.94 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  37.86 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  39.42 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  37.74 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  40.82 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  38.24 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  38.95 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  38.83 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  38.32 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  40.2 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  46.08 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  37.76 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  44.12 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  39.22 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  39.64 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  39.25 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  43.14 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  39.8 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  37.04 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  40.54 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  37.27 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.24 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  38.74 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  37.27 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  36 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  42.57 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  36.04 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  42.27 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  38.68 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  37.84 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  37.38 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  37.84 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  35.78 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  36.45 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  38.68 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  37.62 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  40.59 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  34.55 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  34.55 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  39 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  37.84 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  43.18 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>