296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2609 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  222  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  42.45 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  45.16 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  43 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  41.58 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  47.67 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  40.59 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  37.62 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  36.63 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  40.45 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  41.49 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  40.78 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  42.22 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  34.65 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  44.21 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  36.89 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  34.65 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  38.24 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  41.11 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  41.11 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  37 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  34.95 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  33.67 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  38.54 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  34.34 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  41.57 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  35.58 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  39.33 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  37 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  37 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  34.55 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  34.55 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  35.79 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  38.3 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  33.96 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  31.48 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  36.36 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  37.23 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  37.23 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  31.73 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  32.65 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  33.66 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  33.64 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  33.66 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  35.58 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  33.65 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  37.08 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  29.81 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  32.04 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  32.73 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  35.35 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  35.35 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  35.35 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  35.05 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  34.95 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  32.35 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  41.11 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  34.74 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  31.82 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  37.78 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  33.01 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  32.69 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  31.82 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  34 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  31.48 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  30.56 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  34.34 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  32.35 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  36.46 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  29.09 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  34.74 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  29.63 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3234  hypothetical protein  38.55 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000925848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1077  hypothetical protein  38.55 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>