293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2675 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2675  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  55.14 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  54.29 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1100  hypothetical protein  50.52 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.384347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  49.06 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  49.06 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  48.11 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  45 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  48.11 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  44.95 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  44.95 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  44.95 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  43 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  46.08 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  39.6 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  40.78 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  37.37 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  43.81 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  40.37 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  39.42 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  43 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  43 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  42.57 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  41.9 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  41.9 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  42.06 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  40.59 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0831  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  41.9 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  42.57 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  42.57 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  39.42 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  40.95 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  42.99 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  41.35 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  41.35 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  40.78 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  40.57 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2555  hypothetical protein  36.7 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  40.59 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  40.59 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  39.36 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  40.59 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  39.6 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  41.3 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  40.2 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  35.92 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  41.3 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  39 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  39.6 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  41.58 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  44.58 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  43.48 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  39.6 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  41 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  38 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>