31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1280 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 
135 aa  262  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  41.18 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  41.18 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  32.81 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  31.2 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  34.4 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  33.87 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  32.35 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  36.72 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  38.02 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  36.21 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  36.21 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  35.29 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  36.21 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  35.29 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  37.07 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  35.94 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  35.16 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  35.34 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  32 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  33.33 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  32.38 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  31.09 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  32.71 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  31 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  30.09 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  36.08 
 
 
250 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  27.91 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  33.33 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1003  hypothetical protein  24.21 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0858  toxin secretion/phage lysis holin  26.32 
 
 
149 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00163549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>