31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0366 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 
132 aa  262  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  96.21 
 
 
132 aa  231  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  63.64 
 
 
138 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  42.42 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  39.85 
 
 
138 aa  104  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  47.06 
 
 
180 aa  104  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  37.4 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  40.6 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  48.51 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  37.12 
 
 
141 aa  94.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  40.46 
 
 
137 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  39.71 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  43.69 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  47.57 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  36.36 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  34.09 
 
 
141 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  34.09 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  34.09 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  34.09 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  35.9 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  34.09 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  34.09 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  34.09 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  33.33 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  39.58 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  35.94 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  41.32 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  32 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  33.68 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  25.17 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  32.79 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>