31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0424 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 
139 aa  276  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  94.24 
 
 
139 aa  237  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  71.01 
 
 
138 aa  207  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  66.67 
 
 
136 aa  191  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  65.94 
 
 
141 aa  189  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  70.42 
 
 
146 aa  180  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  60.98 
 
 
180 aa  169  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  65.93 
 
 
136 aa  167  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  60.47 
 
 
137 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  64.8 
 
 
250 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  55.56 
 
 
117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  50.36 
 
 
137 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  51.22 
 
 
141 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  47.69 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  47.69 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  49.59 
 
 
141 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  50.78 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  48.78 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  48.78 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  47.97 
 
 
141 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  47.79 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  39.57 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  47.15 
 
 
141 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  39.39 
 
 
132 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  38.64 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  35.77 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  33.33 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  39.74 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  23.97 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  27.27 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0798  toxin secretion/phage lysis holin  29.58 
 
 
160 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>