32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0370 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  96.21 
 
 		 132 aa  231  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  62.88 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  43.18 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  47.06 
 
 		 180 aa  103  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  38.64 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  39.85 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  36.36 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  37.88 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  39.69 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  47.12 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  44.66 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  39.26 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  46.08 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  34.85 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  39.58 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  35.04 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  36.13 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  32.58 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  32.58 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  32.58 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  32.58 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  32.58 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  32.58 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  42.15 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  31.82 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  32.58 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  32 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  36.78 
 
 		 120 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  24.48 
 
 		 155 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0798  toxin secretion/phage lysis holin  32.04 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  31.15 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>