31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2945 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 
137 aa  268  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  62.5 
 
 
136 aa  174  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  61.86 
 
 
180 aa  155  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  58.09 
 
 
138 aa  153  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  61.9 
 
 
250 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  50.36 
 
 
141 aa  144  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  61.26 
 
 
139 aa  140  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  61.26 
 
 
139 aa  136  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  58.56 
 
 
136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  51.3 
 
 
146 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  50 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  47.37 
 
 
131 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  40.88 
 
 
141 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  41.61 
 
 
141 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  41.61 
 
 
141 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  41.61 
 
 
141 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  41.61 
 
 
141 aa  103  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  41.61 
 
 
141 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  41.61 
 
 
141 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  43.28 
 
 
146 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  42.22 
 
 
141 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  42.03 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  40.44 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  40.46 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  39.69 
 
 
132 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  32.35 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  39.81 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  30.65 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  31.62 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  29.32 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  24.39 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>