31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1704 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1704  toxin secretion/phage lysis holin  100 
 
 		 136 aa  265  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2819  toxin secretion/phage lysis holin  67.65 
 
 		 138 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1487  Phage-related holin  60.9 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2945  toxin secretion/phage lysis holin  62.5 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0122062  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1071  holin  60.45 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.249678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1612  toxin secretion/phage lysis holin  69.57 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000571336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0424  toxin secretion/phage lysis holin  66.67 
 
 		 139 aa  166  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1269  toxin secretion/phage lysis holin  58.21 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1930  toxin secretion/phage lysis holin  61.36 
 
 		 250 aa  153  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0311958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0414  bacteriophage phi-105 protein-like protein  57.25 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1976  toxin secretion/phage lysis holin  54.55 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0586  toxin secretion/phage lysis holin  45.69 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0644  toxin secretion/phage lysis holin  44.26 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0971  toxin secretion/phage lysis holin  42.34 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4074  prophage lambdaba02, holin  41.22 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.124565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3785  prophage LambdaBa02, holin  41.22 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3413  toxin secretion/phage lysis holin  40.46 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000505661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2685  putative prophage LambdaBa02, holin  39.69 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2932  toxin secretion/phage lysis holin  38.76 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000653947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0370  toxin secretion/phage lysis holin  43.18 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0366  toxin secretion/phage lysis holin  42.42 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3768  prophage lambdaba01, holin  41.6 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3491  prophage LambdaBa01, holin  41.6 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000160757  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5852  prophage LambdaBa02, holin, putative  38.93 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3577  toxin secretion/phage lysis holin  38.52 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0161092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1280  toxin secretion/phage lysis holin  31.2 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3883  toxin secretion/phage lysis holin  36.75 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2787  Phage-related holin (Lysis protein)-like protein  43.28 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1331  toxin secretion/phage lysis holin  32.32 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2943  toxin secretion/phage lysis holin  29.53 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0683792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1067  toxin secretion/phage lysis holin  25.41 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.896597  normal  0.443941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>